Institut für Epidemiologie und Pathogendiagnostik
Rostpilze (Ordnung Pucciniales) repräsentieren mit Abstand die meisten Arten auf den EPPO- A1/A2 und EU-Quarantänschadorganismen-Listen für Pilze. Um im Ausbruchsfall oder nach Einschleppung eines Quarantäne-Rostpilzes adäquate Maßnahmen zu ermöglichen, sind robuste, empfindliche und effiziente Diagnosemethoden erforderlich. In diesem Euphresco-Projekt sollen die in den Partnerinstitutionen vorhandenen Ressourcen gebündelt und gemeinsam neue Diagnosemethoden entwickelt werden. Um Diagnosewerkzeuge für Rostpilze zu entwickeln, ist eine umfassende und leicht zugängliche Sammlung gut identifizierter und verifizierter Referenzmaterialien von großer Bedeutung. Die gute Verfügbarkeit von Referenzmaterial, damit verbundenen Sequenzen und positiver Kontroll-DNA wird es den teilnehmenden Laboren ermöglichen, neue Methoden und diagnostische Tests für Rostpilze zu entwickeln und zu validieren. Entsprechend sollen die während der nationalen Untersuchungen gesammelten Proben zum Aufbau einer Bibliothek von DNA-Barcode-Sequenzen (ITS, LSU, Btub, TEF, je nach Erfordernis) verwendet werden. Sobald ein Partner des Konsortiums einen diagnostischen Test entwickelt hat, wird dieser in Vergleichsuntersuchungen auf seine generelle Eignung getestet. MALDI-TOF-Massenspektrometrie-Protokolle haben bereits Potenzial für eine effiziente und spezifische Diagnostik von Pilzen gezeigt. Die Verfügbarkeit von MALDI-TOFInstrumenten in Diagnoselaboren nimmt zu, da diese bereits für die Bakteriendiagnostik verwendet werden. Die Erforschung der breiteren Anwendbarkeit von MALDI-TOF für die Rostpilzdiagnostik und die Entwicklung einer Referenzspektrenbibliothek stellt ein weiteres potentielles Diagnoseinstrument dar, auch im Hinblick auf die Untersuchung eines breiteren Spektrums von Pilzpathogenen bei Pflanzen.
Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft
